Lembaga adalah perangkat departementasi organisasi Nahdlatul Ulama yang berfungsi sebagai pelaksana kebijakan Nahdlatul Ulama, berkaitan dengan kelompok masyarakat tertentu dan/atau yang memerlukan penanganan khusus. Lembaga ini meliputi:
- Lembaga Dakwah Nahdlatul Ulama (LD-NU) [1]
- Lembaga Pendidikan Ma’arif Nahdlatul Ulama (LP Ma’arif NU)
- Rabithah Ma’ahid Islamiyah Nahdlatul Ulama (RMI-NU)* (Indonesia) Lembaga Asosiasi Pesantren Nahdlatul Ulama
- Lembaga Perekonomian Nahdlatul Ulama (LP-NU)
- Lembaga Pengembangan Pertanian Nahdlatul Ulama (LPP-NU)
- Lembaga Pelayanan Kesehatan Nahdlatul Ulama (LPK-NU)
- Lembaga Kemaslahatan Keluarga Nahdlatul Ulama (LKK-NU)
- Lembaga Kajian dan Pengembangan Sumberdaya Manusia Nahdlatul Ulama (LAKPESDAM-NU)
- Lembaga Penyuluhan dan Bantuan Hukum Nahdlatul Ulama (LPBH-NU)
- Lembaga Seni Budaya Muslimin Indonesia Nahdlatul Ulama (LESBUMI-NU)
- Lembaga Zakat, Infaq, dan Shadaqah Nahdlatul Ulama (LAZIS-NU)
- Lembaga Waqaf dan Pertanahan Nahdlatul Ulama (LWP-NU)
- Lembaga Bahtsul Masail Nahdlatul Ulama (LBM-NU)
- Lembaga Ta’mir Masjid Nahdlatul Ulama (LTM-NU)
- Lembaga Kesehatan Nahdlatul Ulama (LK-NU)
- Lembaga Falakiyah Nahdlatul Ulama (LF-NU)
- Lembaga Ta’lif wan Nasyr Nahdlatul Ulama (LTN-NU)
- Lembaga Penanggulangan Bencana dan Perubahan Iklim Nahdlatul Ulama (LPBI-NU)